腸内フローラを構成する細菌の種類やその比率は個人よって異なっています。そのため、原則として一人ひとりが固有の腸内フローラをもっていることになります。一方で、一人ひとりに固有とはいえ、風土や食生活などの生活環境・条件が近い場合は腸内フローラが類似することがあり、例えば同じ国の人々は他国の人々に比べると腸内フローラが類似することが知られています。この腸内フローラに一定の類似性がある点に着目し、腸内フローラを構成する最近のパターン（タイプ）によって分類する試みが欧米を中心に行われ、2011年にはArumugamらによって、ヒトの腸内フローラは３つのタイプに分けられることが報告されました。この際、分類された３つの腸内フローラのタイプを「エンテロタイプ」と呼ぶことにしました。
エンテロタイプ1は、腸内細菌のうちBacteroides属という細菌の占有率が高い群、エンテロタイプ２はPrevotella属の占有率が高い群、エンテロタイプ３はRuminococcus属の占有率が高い群で、これらは現在ではそれぞれのタイプを特徴づける細菌属の頭文字をとって、Bタイプ、Pタイプ、Rタイプと呼ばれています。その後、Holmes らによって、Faecalibacterium属の占有率を基準にBタイプを更にB1、B2タイプの２つに分けるエンテロタイプが提唱され（B1タイプはB2タイプよりもFaecalibacterium属の占有率が高いタイプ）、日本人の腸内フローラに関しては、更にBifidobacterium属の占有率が顕著に高い群の５タイプに分類しました。

いずれにしても、最初に掲げた３タイプが世界共通的に人種を超えてみられるエンテロタイプであるといってもいいようです。その後の臨床研究でエンテロタイプ別の罹りやすい疾患の特徴が解ってきました。

エンテロタイプI：バクテロイデス属細菌が多いタイプで、欧米人や中国人など動物性たんぱく質や脂肪の摂取の多い民族に多い傾向が見られます。最近では日本人の８割程度がこのタイプであると指摘する報告もあります。バクテロイデス属はいわゆる“やせ菌”といわれるもので、肥満を防止する作用があります。バクテロイデス属の菌は食物繊維を分解し、酪酸を作ることにより、脂肪細胞への脂肪取り込みを抑え、筋肉での脂肪燃焼を促すことで代謝を良くします。従ってこのタイプには心筋梗塞や脳梗塞が少ない傾向があるといわれています。
エンテロタイプII：プレボテラ属の細菌が多いタイプです。この菌は難消化性の食物繊維（レジスタントスターチ、難消化性デキストリン）を分解する能力があり、南米、東南アジア、アフリカ人のように穀物食を中心とした民族に多いと言われています。プレボテラ属の細菌は食物繊維を分化して、短鎖脂肪酸である酢酸やプロピオン酸を産生します。血糖値の上昇が抑えられ、糖尿病になりにくいことから、このタイプは最も健康的といわれています。
エンテロタイプIII：ルミノコッカス属の細菌が多いタイプです。雑食傾向のある民族に多く、日本人に比較的に診られるタイプです。食物繊維中のセルロースを分解して、更に糖質や脂肪の吸収が亢進して、肥満や心筋梗塞、脳梗塞が発症しやすくなると言われています。

以上のように腸内フローラをエンテロタイプに分類した結果、生活習慣病と紐づけられることがわかってきました。当院では特にエンテロタイプからみた生活習慣病の予防に取り組み、メタボリックドミノの始まりと言われている肥満、及び脂肪肝の患者さんの腸活を通して、発症予防に努めております。

肥満者においては，ファーミキューテス門の細菌が増加し，一方でバクテロイデス門の細菌が減少していることが報告されています。ファーミキューテス門の細菌は難消化性の食物繊維を分解し，短鎖脂肪酸などのエネルギー源を生成します。ファーミキューテス門の細菌の増加がエネルギー吸収効率を上昇させることにより肥満の発症の一因になっている可能性が考えられます。例えば、日和見菌のバクテロイデス・テタイオタオミクロンの割合が減少し、ファーミキューテス門の細菌が相対的に増えると、肥満や糖尿病になりやすいという報告が実際にありました。テタイオタオミクロン菌には食物繊維を短鎖脂肪酸に分解し、脂肪の蓄積や血糖の上昇を抑える働きがあります。すなわち、腸内細菌種の減少（単純化），少ないはずの細菌種の異常な増加，優位であるはずの細菌種の減少などに代表される腸内細菌叢の乱れ（dysbiosisと言います）が短鎖脂肪酸を生成する菌種を減少させ，結果的に宿主のエネルギー吸収効率が変化し，さらには摂食中枢に一部作用することにより脂肪蓄積が促進され，肥満をもたらす可能性が示唆されるのです。

お肌のくすみやたるみ、しわ、しみなども生活習慣病と大いに関係があります。皮膚の老化は酸化ストレス（紫外線）だけでなく、糖化ストレスが関係していると言われています。特に肥満や糖尿病になると余分な糖分とタンパク質の結合によってAGEs（Advanced Glycation End products：最終糖化生成物）が生成されます。これを「糖化反応（メイラード反応）」と言います。酪酸菌，ビフィズス菌，乳酸菌が産生する乳酸や短鎖脂肪酸はこのメイラード反応を抑える作用を有し、糖化ストレスを軽減する方向に作用します。更に加齢に伴う短鎖脂肪酸産生菌の減少は糖化ストレスの上昇を引き起こします。糖化ストレスはAGEsが組織内に沈着するとともに，RAGE(Receptor for AGEs)に結合して炎症性サイトカインを生成し，微小炎症による組織障害を惹起することにより皮膚の老化を促進します。この糖化ストレスは余分な中性脂肪や LDLコレステロール（LDL-C）からも生じるので、脂質異常症も原因となります。更に生活習慣である睡眠不足や過労，過度な運動，長時間の全身日焼け、過剰飲酒は免疫能を低下させ、お肌の老化が一段と進んでしまいますので、このような状態は避けるべきです。その他にも糖化ストレスによって生体内蛋白が糖化修飾を受けて変化をきたした結果生じる疾患として，白内障，加齢黄斑変性，骨粗鬆症，変形性関節症（OA），アルツハイマー病，卵巣機能の低下，毛髪の老化，動脈硬化などが知られています。

このように病気の予防、早期発見のためにはまず患者さんの腸内細菌の状況を知ることが必要ですが、約400種類もあると言われている腸内細菌のDNA(遺伝子)をt-RFLP法という方法で網羅的に調べることが可能です。この方法で腸内細菌のバランスを判定し、治療法を決定します。検査料は30,000円(税別)となります。当院では腸内フローラの解析結果に基づき、治療法を提案しています。