これらの幹細胞の中で、実用化という面で最も進んでいるのが体性幹細胞です。人工的につくられるES細胞やiPS細胞と異なり、体性幹細胞は私たち自身の体内で実際に働いています。
例えば、赤血球や白血球・血小板など血液の細胞をつくる「造血幹細胞」、神経細胞をつくる「神経幹細胞」、骨・軟骨・脂肪・神経など様々な組織をつくることができるとされている「間葉系幹細胞」などがそれです。

間葉系幹細胞のうち、2001年に脂肪組織中から脂肪肝細胞が発見されると、骨髄幹細胞の100〜1000倍もの幹細胞を比較的容易に確保できること、また、脂肪組織だけでなく骨や軟骨、心筋細胞、また血管を形づくる細胞に分化する能力も保持していることなどが証明され、現在は脂肪幹細胞による臨床応用が多く行われています。
脂肪幹細胞の主な働きには、創傷治癒・分化・免疫調節・新生血管形成などが挙げられ、すでに糖尿病や心筋梗塞・脳梗塞・肝機能障害・アレルギー疾患、変性炎症性疾患（変形性膝関節症）、自己免疫疾患（関節リウマチ）、肺線維症など、様々な病気に対する治療への適用が試みられており、それらの治療効果が報告がされ始めています。
脂肪幹細胞はこの後に述べる臍帯、歯髄および、羊膜の幹細胞と異なり唯一の自家移植となりますので、より安全性は高いと言えます。
間葉系幹細胞には他にも臍帯幹細胞、歯髄幹細胞、羊膜幹細胞があります。臍帯幹細胞は安定的に手に入れることが脂肪幹細胞より困難でありますが、脂肪幹細胞の培養上清液と比較して細胞増殖、抗炎症作用の強いサイトカインを多く含みます。

他家移植となりますが、当院でも採用を予定しています。歯髄幹細胞は子供の乳歯から採取したもので、細胞増殖に関連するサイトカインを多く産生するため、再生増殖能が高いといわれています。特に神経再生に関わるサイトカインが多いと言われており、特に脳梗塞、血管障害、歯周病によいとされています。
当然、他家移植となります。羊膜幹細胞も他家移植となりますが、間葉系幹細胞の中でも増殖性が高く、免疫抑制作用が強いと言われております。特に炎症性疾患に対する効果が注目されています。当院でも将来的に採用を計画しております。
骨髄幹細胞は神経細胞に分化する性質が強く、神経再生能も高いと言われています。しかし、骨髄を採取する技術と経験を要し、しかも幹細胞の含有率が低く、幹細胞の培養技術も難しいため、一般のクリニックではあまり普及していないのが現状です。主に造血幹細胞として血液疾患の治療に用いられています。

このように脂肪幹細胞以外の間葉系幹細胞は他家移植であり、アナフィラキシーなどの拒絶反応のリスクが想定され、日本での実用化はあまり進んでいないのが現状ですが、胎児や乳幼児の組織を用いているため、免疫原性が低く免疫寛容の状態にあると言えますので、比較的安全性は高く、これから日本においても利用されていくことが予想されます。